欢迎来到 阿仪网

免费注册

首页 | 产品 | 求购 | 资讯 | 专题 | 找厂商 | 打听 | 人才 | 品牌 | 资料 | 技术文献 | 展会 | 耗材 | 配件 | 新品 | 促销 | 书籍 | 招标 | 优质仪器
广告
广告

您的位置:首页>仪器仪表资讯>实验室动态>上海巴斯德所等利用RNA编辑策略实现对逆转录转座子的编辑干预

上海巴斯德所等利用RNA编辑策略实现对逆转录转座子的编辑干预

发布时间:2020/5/22编辑:Ma Liang 人气:3181


  【阿仪网 实验室动态】5月19日,Cell Discovery 在线发表了中国科学院上海巴斯德研究所研究员郝沛利用RNA编辑策略、编辑干预逆转录转座子的合作研究论文:Interfering with retrotransposition by two types of CRISPR effectors: Cas12a and Cas13a。该研究利用逆转录病毒/逆转录转座子生命周期中具有DNA和RNA两个不同阶段的特性,首次采用RNA编辑的策略,实现了对逆转录转座子Tf1(类似于逆转录病毒的模式生物)的编辑干预。同时,该工作还第一次采用CRISPR-Cas12a对逆转录病原体的DNA阶段进行编辑,达到了100%的编辑干预效率。

   该研究开拓了对逆转录病原体(包括外源的逆转录病毒、内源性逆转录病毒和逆转录转座子)进行编辑干预的新思路。为RNA编辑和DNA编辑技术应用于逆转录病毒感染阻断、器官移植中的内源逆转录病毒失活和种质资源培育中的逆转录转座子抑制,提供了新的技术策略和并建立了系统参数。

  近年来,CRISPR系统开始发展成为对抗逆转录病原体(包括外源的逆转录病毒、内源性逆转录病毒和逆转录转座子)非常有前途的重要技术。外源和内源性的逆转录病毒是引发人体疾病的严重起因,也是器官移植(同种和异种器官移植术)中重大的风险因素。导致疾病的著名外源和内源性逆转录病毒包括HIV-1、HTLV-1、HERV-K等。前期科学家尝试用CRISPR-Cas9编辑消除病人体内的HIV-1,抑制作为器官移植供体的猪体内内源性逆转录病毒(ERVs),和消除水稻育种中逆转录转座子Tos17的干扰,取得了一定的进展。

  虽然近年来发现的、专门靶向编辑RNA的 CRISPR第VI亚型 Cas13,为对逆转录病原体的编辑干预,提供了新的可能性和技术策略。由于逆转录病毒/逆转录转座子生命周期中具有DNA和RNA两个不同阶段的特性,理论上RNA编辑的方法可以通过编辑RNA中间体,有效干预和对抗逆转录病原体,但这一技术策略迄今为止尚没有被探索过。另外,近年来发现与CRISPR-Cas9类似、作用于DNA的CRISPR第V亚型Cas12a,具有一些优秀特性,包括对PAM区的不同要求、自处理产生crRNA的能力和更高的靶向效率。但到目前为止尚没有Cas12a应用于编辑干预逆转录病原体的报道。本研究在以下几个方面取得了新的进展:

  构建了Tf1逆转录转座的报告系统。为了应用RNA编辑(利用Cas13a)的技术策略和Cas12对逆转录病原体编辑干预,郝沛课题组与合作者首先构建了Tf1逆转录转座的报告系统。他们在Tf1的NEO基因中引入了反向的内含子(构建多达4种不同的内含子序列),这样Tf1转录剪接后新形成的Tf1产物将不具有这些引入的内含子。然后通过设计crRNA,在实验中特异性靶向这些新形成的不包含内含子的Tf1产物。

  首次证明RNA编辑显著干预抑制Tf1逆转录转座活性。郝沛课题组与合作者设计了Cas13靶向Tf1中间转录本的两个特异位点和随机对照的实验,获得了对Tf1转座活性的16%和60%的显著编辑抑制效果。这些结果第一次证明了RNA编辑是对逆转录病原体有效的干预策略。更进一步,对比Cas13a与靶标结合被激活后(由于其乱切割活性)导致原核宿主细胞生长停滞的现象,研究者没有观察到Tf1在真核宿主中激活导致细胞停止生长的现象。这暗示了RNA编辑技术在真核宿主的安全性,也表明Cas13a在真核细胞与细菌细胞中的作用机制有所不同。

  第一次采用CRISPR-Cas12a实现对逆转录病原体DNA阶段进行编辑干预。通过设计Cas12a靶向Tf1逆转录本的多个特异位点(5个crRNA设计)和随机对照的实验,发现Cas12a对Tf1逆转录转座的显著编辑抑制作用(达到90%)——虽然仍有残余的Tf1转座发生。研究者猜测残余的转座活性,是由于Tf1中间产物被VLP包装;さ慕峁。 所以更进一步,通过延长crRNA的表达时间,最终完全消除了残余转座活性,达到了100%的编辑干预效率。

  这些研究成果,开拓了对逆转录病毒/逆转录转座子进行编辑干预的新思路和新方法。比较了RNA编辑和DNA编辑的不同作用机制,完成了两类机制对逆转录病原体复制和转座的编辑干预效果的定量分析,为新技术策略发展建立了基础并提供了系统参数。

  该项研究工作由中科院上海巴斯德所研究员郝沛与中科院分子植物卓越创新中心合成生物学重点实验室研究员李轩、美国密歇根大学教授王红兵(Hongbing Wang)合作完成。张牛冰和荆新云为共同第一作者。相关工作得到国家重点研发计划、中科院战略先导项目和自然科学基金项目的支持。

微信号:ayiwangapp17

(来源: 中国科学院科技产业网 )

标签:

上一篇:金属有机骨架在多药耐药性细菌感染治疗中的应用研究获进展 下一篇:宁波材料所在高比能锂金属负极;し矫嫒〉孟盗薪

为您推荐

相关新闻

高端神外显微镜公开招标公告 发布时间:2020/7/10
  【阿仪网 行业商机】医疗设备(高端神外显微镜) 招标项目的潜在投标人应在新疆政府采购网政采云注册报名下载获取招标文件,并于2020年07月30日 16点00分(北京时间)前递交投标文件。一、项目基
2020年度业务技术装备购置项目医疗设备招标公告 发布时间:2020/7/10
  【阿仪网 行业商机】2020年度业务技术装备购置项目医疗设备 招标项目的潜在投标人应在北京市东城区朝内大街南竹杆胡同6号北京INN 3号楼9层(地铁2号线、6号线,朝阳门站H口出,向南200米)获
科学仪器带您揭秘声音的奥秘 发布时间:2020/7/10
【阿仪网 行业资讯】快节奏的生活与早出晚归的作息,让一部分都市人的睡眠质量受到了影响,而在这个背景下,音乐助眠、白噪音助眠似乎成为一种特殊的消费市场。越来越多的人开始尝试的去购买各式各样的白噪音音频或
浙江声学振动精密测量大平台助力人体健康和重大工程项目 发布时间:2020/7/10
【阿仪网 行业资讯】声学振动精密测量技术主要包括超声、水声、空气声、听力和振动测量等。浙江省计量科学研究院声学振动精密测量大平台始建于2013年,拥有国内一流的实验室条件,声学方面全消声室的截止频率为
湖南发布《化学发光免疫分析仪用参考光源通用技术要求》征求意见稿 发布时间:2020/7/10
  【阿仪网 行业资讯】本标准规定了化学发光免疫分析仪用参考光源的术语和定义、要求、试验方法、标志、标签和说明书、包装、运输和贮存等内容。 本标准适用于对化学发光免疫分析仪用参考光源通用技术要求。根据
上海召开了SEMI中国光伏标准技术委员会2020春季会议 发布时间:2020/7/10
  【阿仪网 行业资讯】近日,上海召开了SEMI中国光伏标准技术委员会2020春季会议,会议上《SEMI PV94-0420,晶体硅光伏组件电池片缺陷电致发光测试方法》、《SEMI PV92-0120
广告

图片视点

应该如何正确使用液相色谱仪?

优质产品

版权声明

凡本网注明"来源:阿仪网"的所有作品,版权均属于阿仪网,未经本网授权不得转载、摘编或利 用其它方式使用。已获本网授 权的作品,应在授权范围内使用,并注明"来源:阿仪网"。违者本网将追究相关法律责任。

本网凡注明"来源:xxx(非本网)"的作品,均转载自其它媒体,转载目的在于传递更多信息,并不代表本网赞同其观点和对其 真实性负责,且不承担此类作品侵权行为的直接责任及连带责任。如其他媒体、网站或个人从本网下载使用 ,必须保留本网注明 的"稿件来源",并自负版权等法律责任。

如涉及作品内容、版权等问题,请在作品发表之日起两周内与本网联系,否则视为放弃相关权利。

旗下频道

色谱仪 光谱仪 反应釜 试验箱 试验机 搅拌器 培养箱 离心机 水分测定 气体检测 量热仪 石油仪器 纯水器 比表面仪 温度记录 流量计 万用表 显微镜 粒度仪 测厚仪 硬度计 酸度计 元素分析 生物试剂 电线电缆 天平衡器 传感器 食品检测 压力仪表 电化学 测厚仪 阀门仪表 电力仪表 干燥设备 药物检测
2016现金赌博app